Historia de BIÓTICA©
La convergencia de numerosas bases de datos en número y tipo (físico y lógico), dado lo diverso de los datos provenientes de los proyectos apoyados (taxonómicos-biogeográficos, ecológico-genéticos, etc); hizo que la CONABIO comenzará a desarrollar un modelo de datos "único", de tal manera que realizar consultas a la información fuese más simple.
BIÓTICA es el nombre de este modelo de datos, que fue implementado en 1995 y constituyó el primer esfuerzo de la CONABIO por unificar, sintetizar y homogeneizar la información taxonómica-biogeográfica (taxorreferenciada) tanto del Sistema Nacional de Información sobre Biodiversidad (SNIB), como para cada uno de los usuarios.
Figura 1 Pantalla principal del sistema de información Biótica© versión 1.0
Figura 2 Pantalla principal del sistema de información Biótica© versión 2.0
Figura 3 Pantalla principal del sistema de información Biótica© versión 3.0
Figura 5 Módulo de semillas en Biótica© versión 4.3
Las siguientes son las versiones que se han desarrollado y la evolución que ha sufrido el sistema de información Biótica:
Sistema de información Biótica© versión 1.0
Hacia septiembre de 1995, el modelo de datos se constituyó en un sistema (pantallas de captura y modelo de
datos); esta primera versión del Sistema de Información Biótica© constaba de 39 tablas relacionadas y un
sistema de captura desarrollado en formas de Access® (véase figura 1).
Figura 1 Pantalla principal del sistema de información Biótica© versión 1.0
Esta versión fue utilizada por 8 proyectos apoyados por la CONABIO.
Debido a la cantidad de datos que se requería ingresar al sistema, a la necesidad de validar la información en una forma mínima, así como a las múltiples solicitudes de expertos que han trabajado con la CONABIO, se modificó el modelo de datos y se realizó un desarrollo completamente nuevo.
Debido a la cantidad de datos que se requería ingresar al sistema, a la necesidad de validar la información en una forma mínima, así como a las múltiples solicitudes de expertos que han trabajado con la CONABIO, se modificó el modelo de datos y se realizó un desarrollo completamente nuevo.
Sistema de información Biótica© versión 2.0
Para mayo de 1996 surgió el sistema de información Biótica© versión 2.0 (véase figura 2), el cual
constaba de 45 tablas.
Figura 2 Pantalla principal del sistema de información Biótica© versión 2.0
Esta versión, usada por alrededor de 90 proyectos y de la cual se realizaron muchas personalizaciones de
acuerdo a requerimientos específicos de los proyectos apoyados, tuvo como objetivos hacer el sistema más amigable y rápido, la
incorporación de algunas estructuras de validación, así como de características completamente nuevas respecto a la
versión anterior.
A continuación se listan algunas de las más significativas:
A continuación se listan algunas de las más significativas:
- Desarrollo de un sistema amigable para el usuario, utilizando PowerBuilder® 4.0.02 como herramienta de desarrollo.
- Modelación y normalización de características (bióticas y abióticas del ejemplar).
- Posibilidad de ejecución en RED (multiusuarios).
- Basónimo.
- Sinonimia nomenclatural.
- Nombre común (geográfico).
- Exportar a SIG (Arc/Info®, ArcView®, ArcExplorer®).
- Reportes fijos definidos por un grupo de usuarios expertos, externos a la CONABIO
Hasta esta versión, el sistema estaba básicamente orientado a la inserción de datos y si bien existían
algunas formas de generar reportes predefinidos por un grupo de usuarios externos a la CONABIO, cuando el
usuario deseaba realizar alguna consulta no predefinida, requería de experiencia en modelos de datos
relacionales y en MS Access®, lo cual complicó la situación, ya que resultaba "difícil" extraer
información.
Como consecuencia de lo anterior, muchas personas se volvieron expertas en el modelo de Biótica© y a su vez áreas como Subdirección de Informática y Subdirección de Inventarios Bióticos de la CONABIO recibieron constantes solicitudes de apoyo en la consulta y uso del sistema, así como de adecuaciones del mismo (personalizaciones).
Es por ello que esta versión tuvo un gran número de variaciones que resolvían problemas específicos de cada usuario.
Como consecuencia de lo anterior, muchas personas se volvieron expertas en el modelo de Biótica© y a su vez áreas como Subdirección de Informática y Subdirección de Inventarios Bióticos de la CONABIO recibieron constantes solicitudes de apoyo en la consulta y uso del sistema, así como de adecuaciones del mismo (personalizaciones).
Es por ello que esta versión tuvo un gran número de variaciones que resolvían problemas específicos de cada usuario.
Sistema de información Biótica© versión 3.0
El tiempo demostró que un sistema útil a los usuarios externos era vital para el éxito y sustento
del Sistema Nacional de Información sobre Biodiversidad, para que todos los usuarios continuaran con su uso
y la consecuente actualización de los datos.
Es por ello que la CONABIO presentó su versión 3.0 (véase figura 3) en enero de 1999, con un desarrollo orientado al usuario (externo) y un modelo de datos compuesto por 33 tablas.
Es por ello que la CONABIO presentó su versión 3.0 (véase figura 3) en enero de 1999, con un desarrollo orientado al usuario (externo) y un modelo de datos compuesto por 33 tablas.
Figura 3 Pantalla principal del sistema de información Biótica© versión 3.0
A continuación se listan algunas de las características nuevas más relevantes en esa versión:
- Herramienta de desarrollo Visual Basic® 5.
- Concepto curador de la base de datos.
- Interacción entre ejemplares.
- Bibliografía (rediseño).
- Grupos (colector y determinador).
- Historia de la determinación.
- Imágenes asociadas al nombre.
- Configuración – Necesidades propias de cada proyecto.
- Sistema de Información Geográfica (lectura de temas geográficos y conexión con Biótica©, transparente al usuario, etc.).
- Validación geográfica.
- Localización semi-automatizada de localidades.
- Reportes dinámicos (exportación a Excel® , Access®, texto delimitado).
- Homonimia taxonómica configurable desde la instalación.
- Ayuda en línea
Esta versión respondió a las múltiples solicitudes de adecuaciones del sistema por los usuarios externos
con un sistema dinámico de catálogos, donde cada usuario puede incorporar los que necesite. La explotación de
los datos se puede hacer de múltiples formas, con un grupo de herramientas que permiten exportar/importar desde
y hacia ciertos sistemas; incluye reportes predeterminados (como en la versión anterior), además de un módulo
de reportes dinámicos que permite al usuario generar consultas no predefinidas sin necesidad de conocer el
modelo de datos a fondo, pues solamente requiere conocer sus propios datos. Asimismo, se ha creado un grupo
genérico de etiquetas, con el fin de que los usuarios que así lo requieran envíen a la CONABIO sus propias
etiquetas de ejemplares para que les fueran implementadas.
Se consideró también la visualización de los datos desde un punto de vista espacial, así como otras actividades que tuviesen que ver con la referenciación geográfica de los ejemplares y, por ello, se desarrolló un pequeño módulo de SIG, que interactúa directamente con los datos capturados.
Se consideró también la visualización de los datos desde un punto de vista espacial, así como otras actividades que tuviesen que ver con la referenciación geográfica de los ejemplares y, por ello, se desarrolló un pequeño módulo de SIG, que interactúa directamente con los datos capturados.
Sistema de información Biótica© versión 3.1
Continuando la tarea de mejorar el sistema tanto para la captura como en la explotación de los datos, CONABIO libera la versión 3.1 del Sistema de Información Biótica el 4 de octubre de 1999, donde algunas de las características más importantes son:
- Herramienta de desarrollo Visual Basic® 6.0
- Rediseño de la pantalla de configuración, dado el incremento de opciones en ella.
- Posibilidad de configurar los grupos de colectores y determinadores.
- Se incluyó la configuración del orden de desplegado para los nombres científicos: alfabético (como en la versión 3.0) y filogenético.
- Se puede seleccionar el idioma con el que se desea trabajar en el sistema: español o inglés.
- Seguridad a nivel de la base de datos.
- Actualización de la base de datos a la versión 3.1 en cuanto el usuario se conecte a una base de datos con el formato de la versión 3.0 o 3.1 beta y confirme el mensaje de actualización.
- Posibilidad, desde la pantalla de datos (captura) del ejemplar, de continuar agregando ejemplares del mismo taxón sin tener que salir de dicha pantalla.
- Posibilidad, desde la pantalla de datos (captura) del ejemplar, de “copiar” los datos del ejemplar recién guardado.
- Posibilidad de cargar todos los reinos a la vez para el ingreso de los ejemplares.
- Rediseño de la pantalla principal del módulo del SIG.
- Generación de archivos en formato "shapefile", para la generación de temas en el SIG.
- El trabajo realizado en el SIG se puede salvar como un proyecto SIG, para recuperarlo más tarde.
- Comunicación entre el reporteador dinámico y el SIG-BIÓTICA, de tal manera que las consultas con información de latitud y longitud se pueden transportar a este módulo y visualizarlas graficamente.
- Validación dinámica (definible por el usuario) en el SIG.
- Ahora los reportes dinámicos se pueden salvar.
- Se implementa “outer join” en los reportes dinámicos, esto es, la obtención de un registro aunque del mismo se hubiese solicitado información no existente.
- Estadísticas básicas sobre la base de datos (número de ejemplares por categoría taxonómica, número de individuos por categoría taxonómica, número de registros en ejemplar, número de ejemplares con localidad, etc.).
- Opción de generar un reporte para solicitud del número de registro.
Sistema de información Biótica© versión 4.0
El 21 de febrero de 2002 se liberó Biótica versión 4.0. Esta versión ofrece herramientas que han sido mejoradas de la versión 3.1 y nuevos desarrollos que permiten conformar un sistema en donde es posible capturar una mayor diversidad de datos, con más opciones de personalización y rutinas de validación de la información. Su modelo de datos está compuesto por 70 tablas.
Se incluye un nuevo módulo de Ecología donde es posible ingresar estudios poblacionales. Utiliza los módulos de nomenclatura y georreferenciación; incluye un catálogo para ingresar los nombres de los especialistas que realizan el estudio (investigadores), un catálogo para indicar a qué tipo de organismo está asociado el estudio (organismo vivo modificado, silvestre, etc.) y uno que contiene información sobre los diversos parámetros que podrían capturarse en un estudio (p. Ej. variación genética, demografía, conducta, ecomorfología, reproducción, aspectos físicos del ambiente, etc.). También se incluye una herramienta que permitirá la generación de códigos de barras.
A continuación se listan algunas de las características nuevas más relevantes en esa versión:
Se incluye un nuevo módulo de Ecología donde es posible ingresar estudios poblacionales. Utiliza los módulos de nomenclatura y georreferenciación; incluye un catálogo para ingresar los nombres de los especialistas que realizan el estudio (investigadores), un catálogo para indicar a qué tipo de organismo está asociado el estudio (organismo vivo modificado, silvestre, etc.) y uno que contiene información sobre los diversos parámetros que podrían capturarse en un estudio (p. Ej. variación genética, demografía, conducta, ecomorfología, reproducción, aspectos físicos del ambiente, etc.). También se incluye una herramienta que permitirá la generación de códigos de barras.
A continuación se listan algunas de las características nuevas más relevantes en esa versión:
- Migración transparente de la base de datos de Biótica 3.1 a Biótica 4.0
- Validaciones en el ingreso de grupos
- Se incluye un catálogo de relaciones entre taxa el cual es personalizable.
- Es posible asociar archivos externos al taxón y al ejemplar
- Se puede desplegar la taxonomía desde cualquier categoría taxonómica
- Se incluye el concepto de región (área geográfica que se define en función de sus características, por ejemplo ambientales, socioeconómicas, etc.) así como sus coordenadas extremas, para que el sistema valide la información ingresada.
- Es posible asociar regiones al taxón
- El ejemplar pede tener más de una región asociada
- Ingreso de interacciones
- Es posible realizar operaciones espaciales (unión e intersección) en el SIG
Sistema de información Biótica© versión 4.1
Hasta la versión 4.0 solo se tenía la opción de usar MS Access© como manejador de la base de datos. El 8 de julio de 2003 se libera la versión 4.1 de Biótica, en ella se agrega la opción de usar MS SQL Server 2000©. El sistema cuenta con una aplicación que permite migrar una base de datos de Biótica 4.0 ó 4.1 a MS SQL Server.
El siguiente diagrama (figura 4) muestra los módulos principales del Sistema de Información Biótica© versión 4.1.
Figura 4 Módulos del Sistema de información Biótica© versión 4.1
El siguiente diagrama (figura 4) muestra los módulos principales del Sistema de Información Biótica© versión 4.1.
Figura 4 Módulos del Sistema de información Biótica© versión 4.1
Sistema de información Biótica© versión 4.2
El 9 de Agosto de 2005 se liberó Biótica© versión 4.2. En donde se agregaron nuevas características y algunas modificaciones en el sistema.
A continuación se listan algunas de las características nuevas más relevantes en esa versión:
A continuación se listan algunas de las características nuevas más relevantes en esa versión:
- Se creó un campo específico para la captura de citas nomenclaturales y uno para el sistema de clasificación.
Se puede borrar un taxón aún cuando éste tenga taxones descendentes y también se muestran las abreviaciones de las categorías taxonómicas infraespecíficas (var., f., etc.) para taxones que pertenezcan a reinos con la categoría taxonómica de división. - Se cambió de nombre al módulo Curatorial por el de Ejemplar.
Se puede acceder a la pantalla Captura y modificación de taxones, desde las pantallas de Determinación y Nombre del ejemplar.
Se incluyó un campo específico para la captura de tipo de procedencia.
Se puede capturar el modificador de la determinación desde la primera determinación del ejemplar.
Se cambió el nombre al módulo Georreferenciación por el de Geografía.
Se incluyó una opción para facilitar el cambio de una localidad hacia otro sitio, cuando ésta ya ha sido asociada a un sitio y a ejemplares.
Es posible el ingreso de más de un grupo de personas cuyo único integrante es la persona ND. - Se puede configurar la categoría taxonómica en el que se recuperan las listas de nombres científicos y también se puede configurar más de una región para el ejemplar.
- Es posible acceder al SIG de Biótica sin la conexión a una base de datos.
Ubicación localidad-sitio ahora se puede dar la distancia en millas terrestres, millas náuticas, pies y yardas.
Los reportes de validación ahora incluye información de la tolerancia con la que se realizó la validación, la ruta y nombre de los mapas y archivos que intervienen en el proceso. - Se creó una herramienta para verificar la estructura de las bases de datos de Biótica.
- Cuando se modifique el nombre de la computadora en donde está instalado Biótica, el número de registro no se invalidará.
Sistema de información Biótica© versión 4.3
Con el objetivo de simplificar la pantalla utilizada para la captura de los datos del ejemplar se desarrolla una nueva versión del sistema Biótica© en la cual se rediseñó la pantalla Datos del ejemplar (figura 5) y se desarrolló un nuevo modulo para el manejo de los datos de bancos de germoplasma de semillas el cual tiene la capacidad de manejar información relacionada con las muestras de semillas tal como:
- Resultados de las pruebas aplicadas a las semillas (rayos X, disección, tetrazolio y germinación).
- Porcentajes de humedad.
- Calidad física de las semillas.
- Cálculo de número de semillas en la muestra y del peso de mil semillas
- Histórico de las muestras de semillas
- Datos de almacenamiento y comportamiento de las semillas
- Características de las muestras de semillas
- Regeneración de la muestra de semillas
Es posible agregar éste módulo desde la instalación del sistema y al migrar una base de datos de versiones
3.X y 4.X de Biótica a la versión 4.3.
Figura 5 Módulo de semillas en Biótica© versión 4.3
En el SIG de Biótica© se incluyó la posibilidad de seleccionar nuevos símbolos para representar objetos geográficos (de tipo punto) y ahora los temas se pueden ordenar arrastrándolos con el ratón sin necesitad del menú para hacer dicho movimiento.
En la pantalla de Nombre-región se incluyó la posibilidad de consultar todos los taxones asociados a algún objeto geográfico y exportar dicha consulta.
En la pantalla de Nombre-región se incluyó la posibilidad de consultar todos los taxones asociados a algún objeto geográfico y exportar dicha consulta.
Sistema de información Biótica© versión 4.5
El 20 de Septiembre del 2006 se liberó la versión 4.5 de Biótica©.
Para la versión 4.5 del Sistema de Información Biótica se realizaron rediseños importantes principalmente en dos módulos (Bibliografía y Geográfico) y se agregaron nuevas caraceterísticas, siendo las más importantes las que a continuación se mencionan.
Para esta versión de Biótica se replantea el objetivo del módulo de Bibliografía el cual es almacenar referencias bibliográficas y no el de porporcionar un manejador de información bibliográfica; por lo cual, se rediseña el módulo de Bibliografía y se simplifica el ingreso y consulta de los datos bibliográficos. Este rediseño consiste en la eliminación del concepto de Tipo de publicación, se simplifica el ingreso de autores separándolos del catálogo de personas y permitiendo la captura del o los autores en un solo campo, se elimina el manejo de niveles para las subpublicaciones.
Se incluye el manejo de información de los sitios descritos por dos coordenadas: línea, punto-radio, polígono además del punto (sitio descrito por una coordenada) que se venía manejando en versiones anteriores. Con lo cual Biótica©, ahora es capaz de manejar información de las áreas de colecta, observación o reporte de los ejemplares o de estudio ecológico descritas por dos coordenadas.
Ahora es posible ingresar más de una configuración para cada usuario, indicar cuál es la configuración activa de ellas y copiar configuraciones entre usuarios.
Se realizó un rediseño de la forma en que se recuperaba la información de las relaciones entre taxones ingresadas en el sistema. Las características más destacables de este rediseño son que la información de las relaciones se recupera en una sección nueva y se incluye la posibilidad de consultar a su vez las relaciones establecidas de los taxones presentados como relacionados al taxón consultado.
Se incluye una nueva carpeta para consultar los taxones ascendentes de un taxón específico, con lo cual se simplifica la visualización de dichos niveles, no siendo ahora necesario recargar el árbol taxonómico.
Se incluye un nuevo campo para el manejo de anotaciones del taxón como son ; nom.legit. , nom. cons., ined., etc.
Incluye una nueva sección para indicar el marco de referencia del ejemplar (con respecto al nivel del mar o con respecto al sitio) de la latitud/ altura / profundidad de colecta, observación o reporte.
El SIG ahora es capaz de generar mapas con información de los nuevos tipos de sitio que se incluyen en el módulo geográfico.
Se incluye una nueva herramienta para verificar la información externa ingresada en la base de datos de Biótica; esta herramienta verifica cuales objetos externos están asociados con información de la base pero no se encuentran en la ruta ingresada, cuales han sido ingresados pero no asociados además de los objetos que han sido asociados y que se encuentran en la ruta ingresada.
Sistema de información Biótica© versión 5.0
En el año 2009 se liberó la versión 5.0 de Biótica.
En ésta versión se incluye un nuevo módulo de manejo de colecciones y se rediseñó el módulo geográfico, a continuación se mencionan algunas de las nuevas características:
Ahora es posible la conexión a bases de datos de Access 2007 (*.accdb)
Se rediseñó la pantalla de ingreso de grupos y personas para facilitar la captura de los datos y agilizar la recuperación de información.
Se rediseñó el catálogo de autoridades para facilitar el ingreso de información y se incluye una sección de búsqueda; ahora es posible modificar los datos de la autoridad de un taxón incluyendo una nueva autoridad en cualquier parte del texto.
El catálogo de relaciones ahora se muestra ordenado alfabéticamente, y al seleccionar un taxón se recupera de manera automática la primer relación que encuentra para éste de acuerdo al catálogo de relaciones; así como el tipo de relación (unidireccional/recíproca). Las relaciones que se hicieron de manera recíproca ahora se eliminan también de ésta manera.
Ahora es posible mover un ejemplar de nombre en caso de haber sido capturado en un taxón erróneo.
No será posible ingresar determinaciones históricas con fechas posteriores a la determinación válida.
Se agrega la posibilidad de manejar coordenadas en cualquier sistema coordenado diferente al estándar de Biótica (coordenadas geográficas en grados, minutos y segundos con DATUM WGS84). Biótica convertirá las coordenadas en cualquier sistema coordenado para almacenar y recuperar los datos tanto en su sistema estándar, como en el sistema en el que fueron capturadas. Se incluye un catálogo de sistemas coordenados con sus parámetros, el cual, podrá ser incrementado por el usuario en caso de ser necesario.
Se rediseñó la pantalla de ingreso de localidades para agilizar la recuperación, el ingreso y búsqueda de la información.
El SIG de Biótica tiene la capacidad de crear mapas (formato shapefile) de los sitios ingresados en otros sistemas coordenados, la tabla del tema incluye los datos de la coordenada tal y como fue capturada.
El módulo de Colecciones es una herramienta para el manejo de la colección en lo que se refiere a manejo del material(préstamos, extensiones de tiempo de los préstamos, envíos del material prestado, transferencias y devoluciones totales o parciales de material prestado, etc.). Es posible manejar tanto la información de los préstamos que hace la colección a otras colecciones como de los préstamos que recibe de material proveniente de otras colecciones (préstamos externos). Comprende también datos de la adquisición y almacenamiento de los ejemplares, tales como:
- Forma de ingreso del ejemplar a la colección.
- Ubicación física del ejemplar, de sus notas de campo y de su catálogo de preparación.
- Estatus del ejemplar (en la colección, en préstamo, baja, etc.)
- El módulo de Colecciones puede agregarse al instalar el sistema o al migrar la base de datos de versiones anteriores a Biótica 5.0.
Se agrega una herramienta de separación de datos, la cual es capaz de extraer datos contenidos en una base de datos de Biótica© 5.0 y llevarlos a otra base de datos, también con la estructura de Biótica© 5.0. El usuario puede definir el conjunto de datos que se extraerá, por ejemplo: todos los datos de una especie, los de una localidad, los de un rango de fechas de colecta, los de un proyecto, etc.
Se incluye para toda la base de datos de Biótica© la fecha en la que se ingresa un registro, así como la última fecha en la cual se modifica.